Гандзасар (Капан)  1999

Как и в прошлом сезоне команда не участвует в розыгрыше Кубка Армении. В очередной раз являясь одним из фаворитов за выход в Премьер-лигу, команда проваливает сезон заняв в итоговой таблице первенства 4-е место. В конце 1999 года, сразу три клуба Премьер-лиги («Ереван», «Эребуни» и «Двин») были расформированы. Таким образом, количество клубов повышающихся увеличилось. Среди них был и «Лернагорц», который был последним включён в состав участников Премьер-лиги.